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高等研究院李猛教授團隊在古菌微生物研究取得新進展

來源: 發(fā)布時間:2018-03-29 16:46 點擊數: Views

近日,高等研究院李猛教授團隊在古菌微生物的生理代謝研究取得了突破性進展。研究工作以“Comparative genomic inference suggests mixotrophic lifestyle for  Thorarchaeota”為題發(fā)表在微生物學頂級刊物The ISME Journal(IF=9.664,doi10.1038/s41396-018-0060-x)。李猛教授為通訊作者,課題組成員劉楊副研究員(原李猛教授博士后)為第一作者,深圳大學為第一完成單位和唯一通訊單位。

古菌作為微生物的一個重要組分,在地球生命演化過程中扮演著極為重要的角色。自從2015年洛基古菌的發(fā)現,到2016年的索爾古菌,以及最近Asgard古菌超級門的發(fā)現和建立,這一類在極端和普通環(huán)境下都有所分布的古菌被認為是迄今以來,距離真核生物起源最近的一類古菌。基于這一類古菌的基因組和功能代謝預測研究為理解真核生物的起源與生命之樹的系統(tǒng)發(fā)育開辟了新的研究道路。李猛教授團隊與香港大學生物科學學院顧繼東教授、美國德克薩斯大學奧斯丁分校Brett J.  Baker教授合作,采用宏基因組和生物信息學技術手段,在深圳灣紅樹林濕地沉積物中獲得了索爾古菌的三個高質量基因組草圖。通過基因組的精細分析發(fā)現,索爾古菌具有降解有機質、固定無機碳、還原硫單質或硫酸鹽,以及產乙酸等代謝途徑(圖1)。研究結果對于認識古菌在生態(tài)環(huán)境中的作用以及揭示真核生物起源等方面都有十分重要的意義。

該研究得到了國家自然科學基金、中國博士后基金、廣東省自然科學基金和深圳市科創(chuàng)委基礎研究項目及孔雀技術創(chuàng)新項目等多項基金的支持。

論文鏈接:https://www.nature.com/articles/s41396-018-0060-x

 

圖:索爾古菌的比較基因組分析

 

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